Der grösste Eingriff erfolgt zwischen Wilen und Waldstatt. Auf diesem Abschnitt werden die Gleise und Schwellen altershalber ersetzt. Weitere Gleisarbeiten finden zwischen Gossau und Herisau statt. Das teilen die Appenzeller Bahnen mit.
In der Zeit der Sperre werden Ersatzbusse eingesetzt. Am Sonntag, 28. April 2013 wird der Bahnbetrieb zwischen Gossau und Waldstatt wieder aufgenommen.