Thönen geht zurück auf Antonius

«Der Familienname Thönen lässt sich eindeutig und leicht erklären», meint Hans-Peter Schifferle vom Schweizerdeutschen Wörterbuch. Thönen sei einer von vielen Familiennamen die auf den altrömischen Personenname und später Heiligenname Antonius zurückgehen.