Im Oktober 2009 trat Gilli sein Amt als «Leiter Spitzensport und Olympische Missionen» bei Swiss Olympic an. Er begleitete die Olympia-Missionen Vancouver 2010, London 2012 und Sotschi 2014.
Die verlorene Olympia-Abstimmung
Mit seiner neuen Firma bleibt Gilli dem Sport erhalten. Er bietet Dienstleistungen im Bereich der Höchstleistungsentwicklung an, steht aber auch für Projektführungen, Planungen oder als Botschafter zur Verfügung. Gilli verlässt Swiss Olympic aus freien Stücken. Im vergangenen August hat er seinen Rücktritt erklärt; als Nachfolger wurde der ehemalige Spitzen-Curler Ralph Stöckli (37) bestimmt.